Para conservar e proteger mercadorias que exigem frigorificação assegurando maior período de conservação, a Ebal mantém em funcionamento um sistema de frigorificação, que está distribuído nos seguintes pontos do Estado: em Simões Filho (Ceasa-Bahia) 24 câmaras para 800 toneladas de produtos; Feira de Santana, Senhor do Bonfim, Vitória da Conquista, Buerarema e em Irecê estão instaladas 01 câmara, cada uma delas com capacidade de armazenamento para 120 toneladas de produtos.